Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms