Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tmf1B9EKI3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmf1B9EKI3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms