Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cttnbp2B9EJA2 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms