Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11bB4XVQ1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms