Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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PtprbB2RU80 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprbB2RU80 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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