Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Spocd1B1ASB6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms