Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PtprsB0V2N1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms