Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms