Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pramef6A2A8M8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pramef6A2A8M8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms