Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mbd3Q9Z2D8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mbd3Q9Z2D8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms