Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cldn9Q9Z0S7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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Cldn9Q9Z0S7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn9Q9Z0S7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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