Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PplQ9R269 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PplQ9R269 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms