Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gpc6Q9R087 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gpc6Q9R087 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpc6Q9R087 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms