Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SrfQ9JM73 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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