Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gde1Q9JL56 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gde1Q9JL56 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms