Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
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Hmgn5Q9JL35 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Hmgn5Q9JL35 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hmgn5Q9JL35 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Hmgn5Q9JL35 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hmgn5Q9JL35 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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