Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN4

C1ql3, Complement C1q-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql3Q9ESN4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C1ql3Q9ESN4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms