Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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