Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ms4a4bQ9ES61 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ms4a4bQ9ES61 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm29803-201ENSMUST00000205069 375 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AL672010.1-201ENSMUST00000215182 1246 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms