Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm12121-201ENSMUST00000131630 500 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 4930553I04Rik-201ENSMUST00000196722 670 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm44862-201ENSMUST00000207981 1055 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 AC133498.1-204ENSMUST00000220830 743 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Riok3Q9DBU3 Mkl2-202ENSMUST00000056715 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms