Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Med27Q9DB40 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms