Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms