Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn22Q9D7U6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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