Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Pramef12Q9D2F1 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pramef12Q9D2F1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms