Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zbed3Q9D0L1 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Zbed3Q9D0L1 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Zbed3Q9D0L1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Zbed3Q9D0L1 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Zbed3Q9D0L1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zbed3Q9D0L1 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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