Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms