Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpusd4Q9CWX4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms