Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms