Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Snw1Q9CSN1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snw1Q9CSN1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Snw1Q9CSN1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Snw1Q9CSN1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snw1Q9CSN1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snw1Q9CSN1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snw1Q9CSN1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snw1Q9CSN1 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snw1Q9CSN1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snw1Q9CSN1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snw1Q9CSN1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snw1Q9CSN1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snw1Q9CSN1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms