Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gnpda2Q9CRC9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gnpda2Q9CRC9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms