Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PompQ9CQT5 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PompQ9CQT5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms