Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ndufb9Q9CQJ8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms