Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQB7

Lyrm1, LYR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm1Q9CQB7 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lyrm1Q9CQB7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms