Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Use1Q9CQ56 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms