Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rpl17Q9CPR4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms