Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bcl11bQ99PV8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms