Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RetnQ99P87 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms