Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gdpd3Q99LY2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Gdpd3Q99LY2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Gdpd3Q99LY2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Gdpd3Q99LY2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gdpd3Q99LY2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms