Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cldn16Q925N4 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cldn16Q925N4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms