Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cabp4Q8VHC5 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms