Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc115Q8VE99 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms