Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rdh10Q8VCH7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rdh10Q8VCH7 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rdh10Q8VCH7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Rdh10Q8VCH7 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Rdh10Q8VCH7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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