Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ssh3Q8K330 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssh3Q8K330 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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