Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc12Q8K2L8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc12Q8K2L8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc12Q8K2L8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc12Q8K2L8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms