Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Depp1Q8K2F3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms