Protein–RNA interactions for Protein: Q8K015

Cenpo, Centromere protein O, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpoQ8K015 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CenpoQ8K015 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.3 ms