Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Card11Q8CIS0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Card11Q8CIS0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms