Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE6

Slc38a2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a2Q8CFE6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Slc38a2Q8CFE6 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Slc38a2Q8CFE6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Slc38a2Q8CFE6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Slc38a2Q8CFE6 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Slc38a2Q8CFE6 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Slc38a2Q8CFE6 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Slc38a2Q8CFE6 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Slc38a2Q8CFE6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Slc38a2Q8CFE6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms