Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccdc38Q8CDN8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ccdc38Q8CDN8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc38Q8CDN8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc38Q8CDN8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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