Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Nhlrc3Q8CCH2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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